Selon la Confédération, la Suisse doit disposer d'une infrastructure écologique fonctionnelle d’ici 2040 – un réseau national de surfaces nécessaires à la conservation de la biodiversité. InfoSpecies a élaboré les bases pour la planification et la mise en œuvre de l'infrastructure écologique par la Confédération et les cantons. Les espèces dites indicatrices de qualité ont joué le rôle principal. Tous les centres de données et d'information des différents groupes d'espèces, dont SwissFungi, ont défini à cet effet, pour différentes guildes d'habitats (p. ex. forêts de conifères de montagne, hauts-marais et marais intermédiaires), de telles espèces qui indiquent des habitats qualitativement intacts. Parmi elles figurent de nombreuses espèces de champignons. La publication InfoSpecies "Quelles surfaces pour le maintien de la biodiversité en Suisse ?" décrit en détail les analyses des surfaces de qualité existantes et des besoins en surface. Le rapport contient en outre une description recommandée des différentes guildes et mentionne les espèces caractéristiques correspondantes.