Auteur : Lena Roth
Dans son travail de master, Lena Roth s'est penchée sur la popularité croissante de l'importation et de la culture de champignons exotiques, ainsi que sur les risques associés à l'introduction de ces espèces dans nos écosystèmes. Pour étudier ce sujet, elle a eu recours à des analyses génétiques, à des expériences d'hybridation et à des analyses d'ADN environnemental (eDNA) issues de pièges à spores.
La culture des champignons connaît un essor mondial, ce qui s'accompagne d'une augmentation du commerce international de mycélium : les souches cultivées sont transportées au-delà des frontières nationales et parviennent ainsi dans de nouvelles régions géographiques.
Les champignons disposent de différents moyens, notamment par le biais de spores ou de substrat composté, pour passer des systèmes de culture à l'environnement naturel. Les risques écologiques liés à ces échanges mondiaux de mycélium font jusqu’à présent l’objet de peu d’attention, bien qu’il existe déjà des exemples de champignons qui se sont échappés des cultures et se propagent de manière envahissante.
Dans le cadre du mémoire de master de Lena Roth chez SwissFungi, ce risque a été étudié sur trois espèces fréquemment cultivées : l'Hydne hérisson (Hericium erinaceus), le cordyceps guerrier (Cordyceps militaris) et le Pholiote adipeuse (Pholiota adiposa). Des analyses phylogénétiques ont montré que de nombreuses souches issues de la culture se distinguent génétiquement des souches indigènes. Ces différences reflètent les origines géographiques diverses des populations d’origine respectives. Dans le cas d’H. erinaceus, cela a même pu être démontré au niveau de l’espèce : les souches cultivées étudiées n’appartenaient pas à H. erinaceus s. str., mais à H. asiaticum ou à H. carolinense. Les souches cultivées et les souches indigènes de C. militaris se distinguaient en outre par leur vitesse de croissance à différentes températures, ce qui indique que les différences génétiques entre les différentes populations peuvent également se traduire par des caractéristiques pertinentes sur le plan écologique. Une expérience d’hybridation menée avec C. militaris, visant à tester un autre mécanisme d’invasion possible, n’a en revanche révélé aucun signe d’hybridation entre les souches étudiées, ce qui n’exclut toutefois pas une telle hybridation dans d’autres conditions ou entre d’autres lignées.
Le mycélium vivant en culture pure n'est généralement pas soumis à la législation commerciale suisse et internationale en vigueur relative aux organismes envahissants et circule donc en grande partie de manière incontrôlée. De plus, les indications d'origine fournies par les commerçants ne correspondent souvent pas à l'origine génétique réelle. Lorsque des souches issues de la culture sont rejetées dans l’environnement, du matériel génétique potentiellement étranger entre en contact avec les populations indigènes. Étant donné que la prévention des introductions est nettement plus efficace que la lutte ultérieure contre des invasions déjà établies, ces résultats plaident en faveur de l'envisagement dès à présent de mesures réglementaires dans le domaine de la culture des champignons.